הכשרת מדריכי פילאטיס היא תהליך הכולל השגת מיומנויות מקצועיות והבנת מחקרים עדכניים בתחום. במהלך ההכשרה, מדריכי הפילאטיס מתרכזים בלמידת הטכניקות המתקדמות של תרגול פילאטיס, כולל הכרת הכלים והמכשירים השונים שמשמשים באימון. בנוסף לכך, מדריכי הפילאטיס נדרשים להיות ממודעים לגוף האנושי ולשמור על בטיחות התלמידים במהלך התרגול.
המרכז הישראלי לפילאטיס – אלטיס, מציע הכשרה מקצועית ברמה גבוהה למי שמעוניין להתמחות כמדריך פילאטיס. התוכנית הראשית של ההכשרה כוללת למידת טכניקת הפילאטיס, היכרות עם מכשירי הפילאטיס, הבנה מעמיקה של יסודות התאוריה הבסיסית של הפילאטיס ולמידת הדרך בה הדרכה יעשה בקבוצות ובאישית. הכשרת המדריכים נערכת באמצעות סדנאות וקורסים מתקדמים, שמאפשרים לציבור להשתלב מיד כמדריכים מעל טמפו לאורך תהליך הכשרתם.
בסיום ההכשרה, מקומם של מדריכי הפילאטיס הם במרכזי פילאטיס, אולמות כושר, מרכזים בריאות ורבים מתאמצים לפתוח את העסקים שלהם. מדריכי הפילאטיס משקיעים משא ומתן בין התלמידים שלהם וממלאים תפקיד מרכזי במתן מענה אישי ויעיל ללקוחותיהם.